Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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VAMP3Q15836 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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