Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ABCF2P1-201ENST00000465687 1867 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PPFIA2-216ENST00000549396 5363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ZNF322-201ENST00000415922 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PPP1R1AP1-201ENST00000525622 425 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 FAM47C-201ENST00000358047 3270 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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MKRN4PQ13434 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
MKRN4PQ13434 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
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MKRN4PQ13434 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 HRH4-201ENST00000256906 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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