Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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CHD4Q14839 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CHD4Q14839 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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