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| CHD4 | Q14839 | GABRB2-201 | ENST00000274547 | 7409 nt | TSL 5 BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | NAP1L4P1-201 | ENST00000319092 | 1157 nt | BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | RGS4-201 | ENST00000367906 | 930 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
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| CHD4 | Q14839 | AL049875.1-202 | ENST00000556620 | 857 nt | TSL 3 BASIC | 5.74 | □□□□□ -1.49 | | |
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| CHD4 | Q14839 | OR10J4-201 | ENST00000504970 | 935 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.74 | □□□□□ -1.49 | | |
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| CHD4 | Q14839 | SOX9-AS1-211 | ENST00000533179 | 460 nt | TSL 3 BASIC | 5.74 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | PSMB7P1-201 | ENST00000556349 | 514 nt | BASIC | 5.74 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | MIR4472-2-201 | ENST00000582069 | 67 nt | BASIC | 5.74 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL159169.3-201 | ENST00000608871 | 561 nt | BASIC | 5.74 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | VPS29-212 | ENST00000621131 | 1124 nt | TSL 3 BASIC | 5.74 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | OR4E1-202 | ENST00000641792 | 3742 nt | APPRIS P5 BASIC | 5.74 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | AASDH-202 | ENST00000451613 | 3182 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | BX322639.1-201 | ENST00000609841 | 6590 nt | TSL 4 BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC093274.1-201 | ENST00000503488 | 5454 nt | TSL 5 BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC100778.3-201 | ENST00000580060 | 1750 nt | BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | CAST-201 | ENST00000309190 | 4282 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | NRIP1-201 | ENST00000318948 | 7556 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | MAPK10-328 | ENST00000641553 | 4009 nt | BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | KIF3A-203 | ENST00000403231 | 2181 nt | TSL 2 BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC007750.1-202 | ENST00000418968 | 4098 nt | TSL 5 BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | AL117339.2-201 | ENST00000430475 | 180 nt | BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | CAB39P1-201 | ENST00000502277 | 460 nt | BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | INPP4B-206 | ENST00000506217 | 673 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC023442.3-203 | ENST00000530946 | 533 nt | TSL 4 BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | AC244502.1-203 | ENST00000541008 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |
| CHD4 | Q14839 | LINC02112-204 | ENST00000606222 | 429 nt | TSL 5 BASIC | 5.73 | □□□□□ -1.49 | | |