Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYVE1Q9Y5Y7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms