Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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