Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTDP1Q9Y5B0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms