Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms