Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COG6Q9Y2V7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms