Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms