Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC5Q9UQL6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms