Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM35Q9UPQ4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms