Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHA7Q9UN72 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHA7Q9UN72 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms