Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNMA2Q9UL42 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms