Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MRTO4Q9UKD2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms