Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FBXL4Q9UKA2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms