Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STAG3Q9UJ98 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STAG3Q9UJ98 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms