Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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