Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms