Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC88CQ9P219 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms