Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHRF1Q9P1Y6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms