Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAPAQ9P0L0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms