Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFCP2L1Q9NZI6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFCP2L1Q9NZI6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms