Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSENENQ9NZ42 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSENENQ9NZ42 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSENENQ9NZ42 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSENENQ9NZ42 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms