Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23BQ9NYZ1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms