Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMOD3Q9NYL9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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