Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GDAP2Q9NXN4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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