Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDL2Q9NX52 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms