Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDP1Q9NUW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TDP1Q9NUW8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms