Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms