Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL1Q9NSC2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms