Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPOLBQ9NRJ5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAPOLBQ9NRJ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms