Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IL1RAPQ9NPH3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms