Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ELL3Q9HB65 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms