Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSPNQ9HAW4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms