Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKRIP1Q9H875 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms