Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPAP3Q9H6T3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPAP3Q9H6T3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms