Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED28Q9H204 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms