Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNTNAP4Q9C0A0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms