Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms