Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms