Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM42Q9BTD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms