Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms