Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms