Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC9Q96Q05 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC9Q96Q05 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms