Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms