Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms