Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms