Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHACTR3Q96KR7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHACTR3Q96KR7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms