Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJD4Q96KN9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms