Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPGRIP1Q96KN7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms